【アニメ2期】
7巻:魔道書「法の書」解読成功したという修道女オルソラ保護の為、ローマ正教、イギ
リス清教の合同作戦に協力させられるインデックスと上条。実は、彼女を攫ったという
天草式が彼女を守ってて、ローマ正教が彼女を処刑する側。騙されてたと知った上条は、
天草式とイギリスのステイル達と共闘、ローマのアニェーゼ部隊を倒しオルソラを救う


8巻:黒子が戦って敗れた黒子以上のテレポーター結標は、実は美琴お姉様の追う敵で、
お姉様の為結標と再戦した黒子は死闘の末力及ばずお姉様と上条に救われましたの。
結標へのトドメは一方通行が刺しましたの。


9,10巻:都市体育祭"大覇星祭"大開催中、"使徒十字"で学園都市を狙うローマ正教の
エロ運び屋オリアナを追う上条、土御門、ステイル。競技や家族ご飯の中同級生姫神や
吹寄がオリアナの手に掛るが、倒す。体育祭の花火で"使徒十字"は失敗。黒幕リドヴィアもイギリス清教が倒した。


11巻:福引ベネチア旅行中,ローマ正教の氷の艦隊の作戦に巻き込まれるインデックスと
上条(と現地人オルソラ)。前回失敗したアニェーゼを生贄にする作戦と知り、天草式と
共闘、指揮官ビアージオを倒す。救ったアニェーゼ部隊はオルソラとイギリス清教入り


12,13巻:"9月30日事件"上条は美琴の罰ゲームデートに呼び出され、上条x打ち止め、一
方通行xインデックスって入れ替え日常コメディの中、突如ローマ正教最強最後の隠し
玉"神の右席"の1番手ヴェント襲来。映像見ただけで昏倒する"天罰術式"で都市は麻痺

　都市理事長アレイスターは風斬を酷使し科学天使"ヒューズ・カザキリ"を出し対抗。
カザキリ発動の鍵・打ち止めが攫われる。一方通行は、攫った猟犬部隊を虐殺し、指揮
官木原数多の木原神拳で撲殺される寸前に新たな力"黒い翼"に目覚め倒す。ヴェントは
上条が倒す。インデックスが歌で打ち止め・風斬を解放。一方通行は都市の暗部組織に
落ちる。ヴェントを回収した別の神の右席アックアを見送るしかなかった上条…